Badania mikroskopowe
Ryzykowne byłoby wyciągnięcie wniosku co do zakażenia rośliny danym gatunkiem bakterii. Niekiedy konieczne jest ponowne wyodrębnienie kultury bakterii z żaka żonej rośliny. Do tego celu należy brać części rośliny położone w pewnej odległości od miejsc pierwszych nakłuć. W większości wypadków przy zakażaniu występują charakterystyczne objawy zewnętrzne, dzięki którym można stwierdzić patogeniczność danej kultury. Przygotowanie preparatów. Niekiedy bakteriozy roślin można określić barwiąc preparaty z tkanek chorych roślin metodą Grama (jeśli sprawca należy do bakterii gramdodatnich). Metoda ta jest, być może, mniej dokładna niż wyodrębnianie bakterii i określanie ich właściwości hodowlanych i biochemicznych. Zaletą jej jednak jest szybkość, a przy dobrej wprawie i dobrym preparacie kontrolnym można uzyskać taką samą dokładność, jak przy posiewach. Barwienie metodą Grama można stosować do określania Corynebact. michiganense w chorych lub podejrzanych o chorobę pomidorach, a zwłaszcza w wypadkach konieczności przeprowadzenia dużej liczby takich analiz.
Cechy patogeniczne bakterii i nie tylko.